慢性咽炎并无特效治疗办法，需要综合性治疗。
首先要积极寻找并去除病因，包括戒除烟酒、改善工作和生活环境（避免粉尘及有害气体）等。局部疗法对一部分患者有确切的疗效，如使用2％硼酸液含漱，碘喉片等。一些对症的中成药也可以考虑使用，进而来缓解咽部症状。如果考虑胃食管反流因素，需要使用抗酸药。手术疗法对于某些特殊类型咽炎也有一定的帮助，可用等离子等处理肥大的淋巴滤泡，但处理范围不宜过大过深，以防日后咽部干燥，咽粘膜萎缩。