女人凌晨两三点醒可能与睡眠呼吸暂停综合征、心脏疾病、胃食管反流等疾病引起的不适有关。具体分析如下：
睡眠呼吸暂停综合征会因为睡眠中发生呼吸暂停而憋醒，表现为女人凌晨两三点醒，晨起时可能会出现头痛、疲乏感、嗜睡、反应迟钝等。
如心功能不全患者，控制不好时，患者会夜间阵发性呼吸困难，需要坐起来才舒服，可表现为女人凌晨两三点醒。
胃食管反流者平躺入睡时胃酸反流导致咽喉部不适可在凌晨两三点醒，可伴有烧心、反酸等症状。
此外，失眠症也可能会导致女人凌晨两三点醒。失眠症是最常见的睡眠障碍，可表现为易醒、入睡困难等。应及时就医，遵医嘱选择合适的药物治疗，辅以心理治疗通常可以改善易醒症状。