一般情况下，造成脑萎缩的原因如下：
由于交通事故、跌倒等意外的头部受损，可引起脑组织损伤，导致脑萎缩。
随着年龄的不断增加，脑组织在一定程度上出现自然萎缩的现象。
阿尔茨海默病和其他形式的老年痴呆，都是由于脑细胞受损引起的；亨廷顿氏病是一种逐渐损害神经元的遗传疾病；白斑病是一种罕见的遗传病，会损害保护神经细胞的髓鞘；多发性硬化是一种自身免疫性疾病，会攻击保护神经细胞周围的涂层，导致神经细胞受损。以上神经疾病也是造成脑萎缩的主要原因。
艾滋病、脑炎、神经梅毒等疾病会伤害神经元和破坏神经元之间的联系，导致脑萎缩。