子宫肌瘤和卵巢囊肿都是妇科的常见疾病，二者之间有着本质的区别，主要体现在以下几方面。
首先二者的发病部位不同，子宫肌瘤的发病部位在子宫体部，在肌层、黏膜层、浆膜层均可发病，而卵巢囊肿的发病部位在子宫两侧的附件部位；其次二者的临床症状也不同，卵巢囊肿有生理性和病理性囊肿，生理性囊肿无临需处理，病理性囊肿会影响排卵、卵巢功能甚至扭转后引起腹痛等症状，而子宫肌瘤均为病理性表现，根据生长速度、部位及大小决定治疗方案；另外二者虽然均以手术治疗为主，但卵巢囊肿多用卵巢切除术或附件切除术，而子宫肌瘤则选用肌瘤摘除术或子宫全切术。