睾丸肿瘤的病因目前尚不清楚，与多种先天性及后天性危险因素有关，包括睾丸肿瘤家族史、对侧睾丸肿瘤病史、睾丸上皮内瘤样病变史，隐睾或睾丸发育不全者的发病机会是正常人的20~40倍。外伤和化学物质损伤以及多种病毒性疾病（麻疹、流行性腮腺炎等）可导致睾丸炎，继发睾丸萎缩和细胞变性，引起睾丸肿瘤。睾丸肿瘤的发生与多种基因改变有关，包括4、5、6和12号染色体基因突变。各种病理类型的睾丸肿瘤与12号染色体短臂异位特异性相关，66%的睾丸上皮内瘤样病变患者可以检测到p53基因改变。